Avec 77 foyers épidémiques actifs, le coronavirus circule toujours en France, mais reste contenu
Les contaminations recensées depuis le déconfinement concernent surtout des établissements de santé, des entreprises et des populations vulnérables. Il n’y a pas pour l’heure de signes d’une reprise de l’épidémie.
Le Monde Par Elisabeth Pineau Publié hier à 05h15, mis à jour hier à 10h48
C’était l’un des principaux enjeux du déconfinement afin d’éviter une reprise de l’épidémie de Covid-19 : circonscrire toute nouvelle chaîne de transmission du virus. Depuis le 11 mai, les agences régionales de santé (ARS), en lien avec les cellules régionales de Santé publique France (SPF) et les collectivités, sont chargées d’enquêter à chaque fois qu’un foyer de contamination (cluster) est détecté. Autrement dit, dès qu’apparaissent au moins trois cas confirmés ou probables, sur une période de sept jours, chez des personnes appartenant à une même communauté ou ayant participé à un même rassemblement.
Entre le 9 mai et le 16 juin, 239 foyers épidémiques, hors établissements d’hébergement pour personnes âgées dépendantes (Ehpad) et milieu familial restreint, ont été recensés, dont 20 dans les départements et régions d’outre-mer, selon le dernier bulletin de SPF. Au 19 juin, 77 étaient encore actifs. « Ces clusters sont en cours d’investigation. Il n’est pas rapporté à ce jour de diffusion communautaire non contrôlée », assure l’agence de santé publique. Le signalement de ces foyers de contagion depuis la levée du confinement « n’est pas une situation inattendue », signale-t-elle. D’une part, parce que le SARS-CoV-2 continue de circuler sur tout le territoire et, d’autre part, en raison des capacités de dépistage accrues et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecté.
Les foyers recensés concernent principalement des établissements de santé (28 %), des entreprises (16 %), ainsi que des personnes en situation de précarité et de vulnérabilité : 14 % en établissements d’hébergement social et d’insertion, et 6 % parmi les communautés vulnérables : migrants, gens du voyage…
« La situation continue globalement de s’améliorer »
Depuis le début du mois de juin, ce sont 385 saisonniers agricoles qui ont été testés positifs dans trois départements du sud de la France : 251 dans les Bouches-du-Rhône, 56 dans le Vaucluse et 78 dans le Gard. Parmi eux, de nombreux travailleurs « détachés » provenant d’Amérique du Sud, embauchés par des agences de travail temporaire espagnoles, qui les mettent à disposition des agriculteurs. « Cette situation requiert toute notre mobilisation, mais, au-delà, on constate sans discontinuité que les indicateurs épidémiologiques sont en baisse en PACA depuis le 11 mai », assure Sébastien Debeaumont, directeur général adjoint de l’ARS PACA.
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Si la Guyane et Mayotte font toujours l’objet d’une surveillance renforcée, le virus y circulant très activement, en France métropolitaine, en revanche, l’ensemble des indicateurs attestent que « la situation continue globalement de s’améliorer et aucun élément n’est actuellement en faveur d’une reprise de l’épidémie », relève Santé publique France. Au 12 juin, le R effectif, c’est-à-dire le nombre moyen de personnes infectées par un cas, est inférieur au seuil de vigilance fixé à 1 dans la majorité des régions, à l’exception de trois d’entre elles, du fait de clusters localisés : Auvergne-Rhône-Alpes, Normandie et Occitanie.
A Chateaurenard , des tests sont effectués sur les travailleurs saisonniers. le 10 juin.
A Chateaurenard , des tests sont effectués sur les travailleurs saisonniers. le 10 juin. CLEMENT MAHOUDEAU / AFP
En outre, l’incidence (le nombre de nouveaux cas rapportés à la population pour 100 000 habitants) est inférieure à 10 dans tous les départements, exceptés dans le Gard, la Meuse et la Meurthe-et-Moselle. Des chiffres que les autorités de santé n’interprètent pas comme les prémices de la seconde vague redoutée. Ils s’expliquent par une circulation virale « un peu plus élevée » dans ces départements par rapport aux autres territoires et par le fait qu’« actuellement, la Meurthe-et-Moselle et la Meuse sont les deux départements français qui testent le plus », justifie l’ARS Grand-Est.
« Très peu de formes graves »
Dans la région a été déployée « une stratégie de dépistage massif dans les établissements médico-sociaux, les foyers, etc. Evidemment, le virus circule encore, mais quand vous allez le chercher, vous le trouvez », abonde la docteure Guilaine Kieffer-Desgrippes, présidente de l’Union régionale des professionnels de santé (qui représente les médecins libéraux) du Grand-Est. Entre le 13 mai et le 17 juin, grâce au dispositif de traçage de l’Assurance-maladie, 2 763 nouveaux cas de Covid-19 ont été confirmés biologiquement et 8 213 personnes contacts identifiées. « Mais ce qui est important à noter, c’est qu’il y a très peu de formes graves, insiste la docteure Kieffer-Desgrippes. On scrute beaucoup le nombre d’hospitalisations, notamment en réanimation, qui est quasiment à zéro aujourd’hui. Dans nos cabinets, l’activité Covid est sporadique. Nous ne sommes pas inquiets car les retours positifs de tests PCR sont très faibles, on voit plutôt des pathologies virales classiques. »
Au 16 juin, on dénombrait encore 56 foyers de contagion dans le Grand-Est, dont 33 correspondent à des Ehpad. Compte tenu de l’impact de l’épidémie dans la région, proportionnellement l’une des plus touchées, « il n’est pas illogique de se trouver en présence de foyers infectieux sporadiques, précise l’ARS Grand-Est. Toutefois à ce stade, il n’y a pas de signes de reprise de l’épidémie. »
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« Il faut continuer à être très prudent »
Autre région étroitement scrutée : l’Ile-de-France. Si elle est repassée au vert à la faveur d’indicateurs plus favorables, elle enregistre encore en moyenne 1 000 nouvelles contaminations par semaine. Au 17 juin, 37 foyers épidémiques étaient encore actifs, dont 29 en établissements de santé et dans les Ehpad. Plus de 70 % sont à ce jour maîtrisés, les autres sont en cours d’investigation. « On ne veut pas tirer de conclusions trop hâtives, on reste extrêmement vigilants », insiste-t-on à l’ARS Ile-de-France. Jusqu’à fin juin, l’agence va ainsi continuer à mener des opérations de dépistage itinérant dans des territoires où a été constatée une surmortalité durant l’épidémie, où la population, contrainte de continuer à aller travailler, n’a pu être confinée, ou n’a pas forcément accès aux soins. A ce jour, plus de 9 000 personnes ont été dépistées par ce biais, avec un taux de positivité autour de 1 %.
Plus rarement, des regroupements de cas surgissent dans le milieu familial élargi (9 %) ou scolaire (4 %). Le 13 juin, un cluster intrafamilial a ainsi été identifié en Haute-Garonne. La contamination s’est faite lors d’un repas rassemblant 52 personnes le 1er juin à Blagnac. Les cinq familles contaminées ont été en contact avec une personne « infectée au Covid-19 de retour d’Allemagne », précise l’ARS Occitanie. Dans la région, en revanche, l’activité Covid-19 en médecine de ville « est marginale, moi-même je n’ai pas vu de cas depuis le déconfinement », atteste Jean-Paul Ortiz, médecin néphrologue dans les Pyrénées-Orientales. Pour le président de la Confédération des syndicats médicaux français (CSMF), premier syndicat chez les médecins libéraux, « le fait qu’il y ait des clusters aujourd’hui montre d’une part que le système d’identification et de traçage marche bien, et permet de bien contrôler ces foyers. Et, d’autre part, ça témoigne d’une circulation du virus et d’un relâchement sur les gestes barrières. Il faut continuer à être très prudent ».
En Provence, le démarrage de la saison touristique concentre désormais l’attention des autorités sanitaires : « On anticipe au maximum avec tous les acteurs pour définir un modus operandi, assure Sébastien Debeaumont, de l’ARS PACA, et ainsi mettre en place les mesures à prendre si un cluster venait à être signalé. »